Protein–RNA interactions for Protein: P0DJH9

RD3L, Protein RD3-like, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RD3LP0DJH9 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ARHGAP8-204ENST00000389774 1725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
RD3LP0DJH9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms