Protein–RNA interactions for Protein: P0C6C1

ANKRD34C, Ankyrin repeat domain-containing protein 34C, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD34CP0C6C1 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ANKRD34CP0C6C1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms