Protein–RNA interactions for Protein: P05386

RPLP1, 60S acidic ribosomal protein P1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPLP1P05386 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RPLP1P05386 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RPLP1P05386 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms