Protein–RNA interactions for Protein: P04004

VTN, Vitronectin, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTNP04004 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
VTNP04004 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
VTNP04004 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
VTNP04004 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
VTNP04004 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTNP04004 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTNP04004 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTNP04004 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTNP04004 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTNP04004 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
VTNP04004 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
VTNP04004 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
VTNP04004 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms