Protein–RNA interactions for Protein: P02656

APOC3, Apolipoprotein C-III, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC3P02656 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
APOC3P02656 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms