Protein–RNA interactions for Protein: P01374

LTA, Lymphotoxin-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTAP01374 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
LTAP01374 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
LTAP01374 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
LTAP01374 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTAP01374 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTAP01374 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
LTAP01374 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms