Protein–RNA interactions for Protein: O95237

LRAT, Lecithin retinol acyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRATO95237 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
LRATO95237 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
LRATO95237 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
LRATO95237 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRATO95237 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRATO95237 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRATO95237 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRATO95237 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRATO95237 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
LRATO95237 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRATO95237 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms