Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ECM2O94769 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
ECM2O94769 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ECM2O94769 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ECM2O94769 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms