Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
TRPM2O94759 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.64■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
TRPM2O94759 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms