Protein–RNA interactions for Protein: O75293

GADD45B, Growth arrest and DNA damage-inducible protein GADD45 beta, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GADD45BO75293 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GADD45BO75293 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GADD45BO75293 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms