Protein–RNA interactions for Protein: O75197

LRP5, Low-density lipoprotein receptor-related protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,615 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP5O75197 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LRP5O75197 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LRP5O75197 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LRP5O75197 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LRP5O75197 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LRP5O75197 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP5O75197 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP5O75197 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP5O75197 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
LRP5O75197 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms