Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CTNSO60931 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CTNSO60931 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CTNSO60931 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CTNSO60931 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CTNSO60931 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CTNSO60931 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms