Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PPLO60437 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PPLO60437 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PPLO60437 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PPLO60437 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPLO60437 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPLO60437 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPLO60437 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPLO60437 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PPLO60437 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
PPLO60437 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PPLO60437 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PPLO60437 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PPLO60437 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PPLO60437 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms