Protein–RNA interactions for Protein: O60248

SOX15, Protein SOX-15, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX15O60248 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SOX15O60248 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
SOX15O60248 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX15O60248 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX15O60248 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX15O60248 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX15O60248 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
SOX15O60248 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms