Protein–RNA interactions for Protein: O43852

CALU, Calumenin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALUO43852 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALUO43852 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALUO43852 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CALUO43852 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CALUO43852 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CALUO43852 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CALUO43852 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CALUO43852 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CALUO43852 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CALUO43852 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms