Protein–RNA interactions for Protein: O43739

CYTH3, Cytohesin-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH3O43739 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CYTH3O43739 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CYTH3O43739 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms