Protein–RNA interactions for Protein: O43581

SYT7, Synaptotagmin-7, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT7O43581 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYT7O43581 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
SYT7O43581 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
SYT7O43581 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms