Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RNF13O43567 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF13O43567 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF13O43567 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF13O43567 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF13O43567 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF13O43567 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
RNF13O43567 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms