Protein–RNA interactions for Protein: O15084

ANKRD28, Serine/threonine-protein phosphatase 6 regulatory ankyrin repeat subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28O15084 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
ANKRD28O15084 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms