Protein–RNA interactions for Protein: O15015

ZNF646, Zinc finger protein 646, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF646O15015 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.95■■□□□ 1.27
ZNF646O15015 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZNF646O15015 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms