Protein–RNA interactions for Protein: O14829

PPEF1, Serine/threonine-protein phosphatase with EF-hands 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPEF1O14829 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPEF1O14829 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPEF1O14829 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms