Protein–RNA interactions for Protein: O00221

NFKBIE, NF-kappa-B inhibitor epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIEO00221 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NFKBIEO00221 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NFKBIEO00221 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms