Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GOLGA8SH3BPF8 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
GOLGA8SH3BPF8 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms