Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
LINC00587B1AMM8 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms