Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
ODF3BA8MYP8 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms