Protein–RNA interactions for Protein: A6NKB5

PCNX2, Pecanex-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 2,137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX2A6NKB5 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
PCNX2A6NKB5 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms