Protein–RNA interactions for Protein: A6NEY3

GOLGA6L3, Putative golgin subfamily A member 6-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L3A6NEY3 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GOLGA6L3A6NEY3 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GOLGA6L3A6NEY3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms