Protein–RNA interactions for Protein: A6NDR6

MEIS3P1, Putative homeobox protein Meis3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3P1A6NDR6 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
MEIS3P1A6NDR6 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms