Protein–RNA interactions for Protein: A6NDB9

PALM3, Paralemmin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 673 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALM3A6NDB9 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
PALM3A6NDB9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PALM3A6NDB9 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms