Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
KLHL33A6NCF5 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
KLHL33A6NCF5 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms