Protein–RNA interactions for Protein: A5D8V6

VPS37C, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS37CA5D8V6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
VPS37CA5D8V6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
VPS37CA5D8V6 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms