Protein–RNA interactions for Protein: A5A3E0

POTEF, POTE ankyrin domain family member F, humanhuman

Predictions only

Length 1,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEFA5A3E0 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POTEFA5A3E0 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POTEFA5A3E0 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms