Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FRMD3A2A2Y4 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FRMD3A2A2Y4 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms