Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J244

TRAV3, T-cell receptor alpha variable 3 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV3A0A0B4J244 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRAV3A0A0B4J244 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRAV3A0A0B4J244 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms