Protein–RNA interactions for Protein: Q14964

RAB39A, Ras-related protein Rab-39A, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB39AQ14964 AC004160.1-202ENST00000599917 578 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CEACAM7-204ENST00000602225 524 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 5S_rRNA.16-201ENST00000612928 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 PARP11-201ENST00000228820 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 PARP11-203ENST00000427057 4406 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 FAM107B-229ENST00000622567 3510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CNTN1-201ENST00000347616 5507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 OR9Q2-202ENST00000641291 3774 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 R3HDM1-201ENST00000264160 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 EOGT-209ENST00000540955 1332 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 OR10Z1-202ENST00000641002 6323 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 FAM35A-201ENST00000298784 3402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 U3.3-201ENST00000362986 216 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 Y_RNA.493-201ENST00000384422 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL121834.1-202ENST00000404494 277 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 ARSD-AS1-201ENST00000414053 816 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL691482.1-201ENST00000453255 87 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL672167.3-201ENST00000465951 960 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC146507.1-201ENST00000468335 354 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RNA5SP92-201ENST00000516437 110 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RNA5SP34-201ENST00000516887 130 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 LINC00944-201ENST00000536517 421 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 DNAL1-205ENST00000554339 548 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC109630.1-202ENST00000560552 579 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB39AQ14964 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL391813.2-201ENST00000609113 322 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 STARD13-AS-239ENST00000609588 982 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC006329.2-201ENST00000611491 394 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CCL14-204ENST00000622526 472 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB39AQ14964 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.54□□□□□ -1.68
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RAB39AQ14964 CTSLP2-203ENST00000628708 493 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 LINC01102-204ENST00000451400 3778 ntTSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CNTN5-212ENST00000619298 5734 ntTSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 PRUNE2-208ENST00000443509 12356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 TMEM71-201ENST00000356838 1993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 TMEM71-210ENST00000523829 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 OBSCN-204ENST00000366707 26772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 VPS13C-201ENST00000249837 13300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 NBPF9-208ENST00000621074 4302 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 MAPK10-320ENST00000641462 6696 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 CENPI-202ENST00000372927 3262 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 SYNE2-203ENST00000357395 21555 ntTSL 5 BASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 PKIB-202ENST00000354275 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 SNORA2.3-201ENST00000383920 135 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 U3.20-201ENST00000390909 217 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 MTCO3P40-201ENST00000392516 676 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL049693.1-201ENST00000402760 611 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
RAB39AQ14964 RN7SKP126-201ENST00000411143 300 ntBASIC4.53□□□□□ -1.68
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