Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR5

KRTAP4-2, Keratin-associated protein 4-2, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-2Q9BYR5 CSPG4P5-201ENST00000558731 3730 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PPM1L-202ENST00000464260 2735 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 HBP1-208ENST00000468410 2704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATG12-208ENST00000509910 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PREPL-201ENST00000260648 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TCF21-201ENST00000237316 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AL162727.1-201ENST00000437712 3043 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PRICKLE2-AS1-201ENST00000482609 6505 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 INTS3-201ENST00000318967 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 R3HDM2-205ENST00000403821 3347 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF200-204ENST00000414144 3306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RBM26-201ENST00000267229 3624 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF841-202ENST00000426391 3620 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TAF5L-204ENST00000366676 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 IRF5-213ENST00000489702 2988 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC12A3-201ENST00000262502 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GPR161-208ENST00000537209 8256 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GREB1L-202ENST00000424526 6052 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NPC1L1-204ENST00000546276 4826 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 EMC1-207ENST00000477853 6664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SLC12A6-206ENST00000558589 3866 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PARP6-202ENST00000287196 2625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AC012508.1-201ENST00000564121 4476 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MEIS2-206ENST00000424352 2917 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GBAP1-202ENST00000459805 2922 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ADGRF3-201ENST00000311519 3240 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATG5-204ENST00000369076 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF641-203ENST00000544117 7819 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CDC40-201ENST00000307731 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GPRASP2-204ENST00000535209 3847 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATF7IP-214ENST00000540793 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MME-203ENST00000460393 5622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PMS2-201ENST00000265849 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ASIC2-202ENST00000359872 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MAML2-202ENST00000618849 3154 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ETS2-202ENST00000360938 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF568-202ENST00000415168 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 GRM1-207ENST00000507907 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FAM53C-201ENST00000239906 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AMMECR1L-201ENST00000272647 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AP000356.2-201ENST00000639904 4634 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MYO1F-201ENST00000338257 4303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PIGK-203ENST00000445065 4318 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PPARGC1B-204ENST00000403750 3146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ENSA-204ENST00000356527 2546 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NRXN1-206ENST00000402717 2508 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SERPINA5-205ENST00000554276 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LYRM7-201ENST00000379380 6351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 WIPF1-204ENST00000392547 4587 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ACAA2-201ENST00000285093 3350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ESRRG-212ENST00000463665 3359 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RRM1-201ENST00000300738 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 DICER1-214ENST00000556045 2776 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ETV6-202ENST00000396373 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AC008124.1-201ENST00000609803 9730 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NLRP1-216ENST00000617618 4788 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SEMA6D-204ENST00000358066 5913 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PFKFB3-205ENST00000379789 4157 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 NPC1L1-201ENST00000289547 5048 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ATP1A3-201ENST00000302102 3597 ntTSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FUT8-204ENST00000394586 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PPIP5K1-201ENST00000334933 5586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 HPCAL4-202ENST00000612703 4436 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AC023790.2-201ENST00000543321 2403 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 EXD2-203ENST00000409018 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 PIK3R5-209ENST00000581552 3253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 FKBP14-201ENST00000222803 4960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MRS2-201ENST00000274747 3821 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TNNT3-202ENST00000344578 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 STAG3L4-201ENST00000352103 530 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RNY1P13-201ENST00000365030 105 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TNNT3-205ENST00000381563 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TNNT3-208ENST00000397301 818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TNNT3-209ENST00000397304 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 MIR885-201ENST00000401316 74 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AL353692.1-201ENST00000405081 755 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORA11.3-201ENST00000408471 128 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 ZNF70P1-201ENST00000417480 624 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 IQCF4-204ENST00000433169 414 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 AL031316.1-202ENST00000441672 449 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 TNNT3-210ENST00000446240 720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RPS18P13-201ENST00000461260 454 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SL724P-201ENST00000461895 271 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
KRTAP4-2Q9BYR5 RN7SL402P-201ENST00000465059 264 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137 ms