Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 EEF1B2P1-201ENST00000567221 672 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC233702.7-202ENST00000582941 211 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RPSAP66-201ENST00000592196 606 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 BDH2P1-201ENST00000602288 736 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SMAGP-208ENST00000605627 577 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC024255.1-201ENST00000614376 102 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 HIST1H4L-201ENST00000618305 312 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL356289.1-201ENST00000635446 743 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MIR3120-201ENST00000636555 81 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ORMDL1-201ENST00000325795 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 GABRG2-217ENST00000639384 5360 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CLCN5-202ENST00000376088 10108 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PDE1A-204ENST00000410103 2000 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SCN11A-202ENST00000444237 5729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MTX3-204ENST00000617335 6155 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AGTR1-208ENST00000475347 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SCN2A-207ENST00000631182 8430 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ERMARD-205ENST00000418781 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 DSC3-201ENST00000360428 6939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 TPK1-207ENST00000538212 2243 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MS4A1-202ENST00000389939 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MSL2-202ENST00000434835 2272 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL445189.1-201ENST00000405722 338 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MIR1306-201ENST00000408439 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 NT5C3A-205ENST00000409467 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CTSLP8-201ENST00000413075 967 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL035401.1-201ENST00000420572 871 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC007562.1-201ENST00000421819 517 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SNX18P14-201ENST00000429308 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL121776.1-201ENST00000429337 372 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL445928.1-201ENST00000435545 222 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 LINC01525-201ENST00000442182 511 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RPSA-202ENST00000443003 1032 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MED28P3-201ENST00000444288 531 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PRDX3P3-201ENST00000447765 522 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC079944.1-201ENST00000485426 495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC026801.1-201ENST00000497178 464 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC105999.1-201ENST00000518722 473 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC111149.1-201ENST00000522560 343 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ERHP1-201ENST00000523006 310 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PGAM1P8-201ENST00000526979 453 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 TMEM269-202ENST00000536543 983 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC027801.5-201ENST00000574365 416 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC005410.2-201ENST00000580270 463 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 FARSA-AS1-201ENST00000592636 241 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC008794.1-201ENST00000593063 560 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL645949.1-202ENST00000600073 242 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC009686.2-201ENST00000607017 577 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC239809.3-203ENST00000611286 1050 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AC007326.3-201ENST00000636418 176 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PBRM1-207ENST00000409767 4849 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ADGRL3-218ENST00000514996 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 AL445623.2-201ENST00000640307 4805 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ADAM2-207ENST00000622267 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CHST9-203ENST00000618847 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-207ENST00000443462 4042 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 TRPM6-203ENST00000361255 8271 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ZNF546-201ENST00000347077 7987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 CSMD1-215ENST00000537824 13512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 BABAM2-206ENST00000379632 1752 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP176-201ENST00000390956 110 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
ANKRD39Q53RE8 PTMAP8-201ENST00000397729 342 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms