Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AP001784.1-201ENST00000624107 428 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PDE4D-229ENST00000638939 375 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL596275.2-204ENST00000641628 552 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL596275.2-206ENST00000641957 626 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 GPBP1-205ENST00000511209 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 HELZ-207ENST00000580168 6279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SLX4IP-201ENST00000334534 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CYP7A1-201ENST00000301645 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PTPRB-210ENST00000551525 5291 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC109446.4-201ENST00000623235 2755 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 STAP1-201ENST00000265404 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 VPS13B-203ENST00000358544 14094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 GJA9-201ENST00000357771 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 EEF1A1-210ENST00000610520 3447 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MED12L-206ENST00000474524 10744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ESRRG-224ENST00000616180 5194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PRDM2-206ENST00000413440 6175 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PICALM-209ENST00000528398 2049 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC005294.1-201ENST00000355509 281 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL122016.1-201ENST00000403365 367 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC092675.1-201ENST00000409490 561 ntTSL 4 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL391807.1-202ENST00000419979 534 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 TXNIP-201ENST00000425134 1225 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC090804.1-201ENST00000448870 490 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AL445524.1-204ENST00000454631 458 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC068305.1-201ENST00000497406 726 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 DEFB130C-201ENST00000528518 237 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 POT1-AS1-205ENST00000453342 3252 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 LINC00240-204ENST00000607607 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 DCC-202ENST00000412726 9525 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 FGF1-202ENST00000359370 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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ECM1Q16610 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RNU6-193P-201ENST00000410977 107 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC008154.2-201ENST00000420268 414 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC092832.1-201ENST00000422934 400 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 DUTP6-201ENST00000425573 462 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 Z80107.2-201ENST00000445127 392 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
ECM1Q16610 AC128716.1-201ENST00000475129 166 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
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