Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 SCN3A-209ENST00000639244 8854 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RNU6-298P-201ENST00000390888 96 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 TAF9BP1-201ENST00000396646 746 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 SNORA11.2-201ENST00000408318 127 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC068599.1-201ENST00000422558 567 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL031313.1-201ENST00000448435 256 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC239798.3-201ENST00000454459 408 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC087636.1-201ENST00000554787 573 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 MIR5004-201ENST00000579078 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC125494.3-201ENST00000602759 455 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL513477.2-201ENST00000607858 568 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 C2orf73-208ENST00000615983 1376 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC046195.1-201ENST00000518973 4171 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 MT-ND2-201ENST00000361453 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL022310.1-201ENST00000436974 690 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RPL23AP23-201ENST00000452590 471 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC123023.1-201ENST00000455974 555 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC092919.1-201ENST00000467896 229 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC069499.1-201ENST00000489433 509 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LINC02113-201ENST00000510302 336 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RNU4ATAC6P-201ENST00000516592 126 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LINC02399-201ENST00000547094 400 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC023825.1-201ENST00000566704 1030 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC145350.1-201ENST00000567426 208 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC007014.1-201ENST00000572828 610 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 MTCO3P22-201ENST00000603219 784 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL139395.1-201ENST00000603662 160 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AP000676.3-201ENST00000623299 569 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 CR392039.4-201ENST00000624968 501 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 CSNK1G3-210ENST00000521364 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LINC00862-204ENST00000637098 1400 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 KRTAP22-2-201ENST00000382830 293 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL603766.1-201ENST00000407763 664 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 PTP4A1P1-201ENST00000420539 515 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC007563.3-201ENST00000433233 371 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
ERVV-2B6SEH9 AC112492.1-201ENST00000449607 712 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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