Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ2

KRTAP9-4, Keratin-associated protein 9-4, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC145543.1-201ENST00000424770 586 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KRT18P12-201ENST00000425245 1273 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PTMAP4-201ENST00000426188 346 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AL133387.1-201ENST00000442188 382 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC099560.2-201ENST00000457554 255 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL419P-201ENST00000471592 287 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPS10P16-201ENST00000483812 496 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL461P-201ENST00000484915 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AIG1P1-201ENST00000503376 148 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006487.2-201ENST00000503624 577 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC091180.2-203ENST00000507337 601 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC233724.11-201ENST00000508480 404 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SCGB1D5P-201ENST00000515134 247 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGHV3-75-201ENST00000523951 358 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RAD52-217ENST00000544742 463 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC009779.4-201ENST00000554248 611 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC007494.1-201ENST00000562293 760 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092718.2-201ENST00000562315 487 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 C16orf62-224ENST00000567245 573 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL45P-201ENST00000578050 298 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL531P-201ENST00000578464 282 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC015688.1-201ENST00000584894 199 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC00649-209ENST00000597626 612 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC020908.1-201ENST00000598893 280 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC008687.3-201ENST00000599209 598 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGLVIVOR22-1-201ENST00000603243 397 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC092175.1-201ENST00000605325 200 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GNAS-AS1_2.1-201ENST00000613404 114 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RFPL3-AS1_1.2-201ENST00000618747 88 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RN7SL650P-201ENST00000619902 299 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC132825.5-201ENST00000640603 310 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DOCK3-201ENST00000266037 8755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PLS1-202ENST00000457734 3706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN2A2-202ENST00000356709 3590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FOXM1-202ENST00000359843 3315 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CX3CL1-201ENST00000006053 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LPIN1-201ENST00000256720 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 IGSF11-201ENST00000354673 3206 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DNAJC6-202ENST00000371069 5365 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ATG16L1-205ENST00000392020 3213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HINFP-201ENST00000350777 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TWNK-202ENST00000370228 3175 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MED23-205ENST00000368068 5233 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 POM121L2-202ENST00000444565 3108 ntAPPRIS P2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF559-213ENST00000603380 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMCO4-201ENST00000294543 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TMEM200A-203ENST00000545622 2918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CDHR1-206ENST00000623527 6781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 BTN2A1-207ENST00000541522 2845 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 USP54-204ENST00000422491 2777 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TOX4-203ENST00000448790 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC012613.2-201ENST00000523176 4533 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MTSS1-202ENST00000378017 4458 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL5-204ENST00000504108 2690 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TIMELESS-201ENST00000229201 4376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EIF2AK2-203ENST00000395127 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLSTN3-207ENST00000537408 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TACC2-228ENST00000515273 9245 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MYO18A-214ENST00000533112 7522 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CHEK1-204ENST00000438015 4153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 EGFLAM-203ENST00000354891 3963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPOCD1-202ENST00000360482 3960 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 CLIP1-209ENST00000537178 5229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 C4BPA-201ENST00000367070 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC005358.2-201ENST00000584772 3679 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC006030.1-201ENST00000451608 5059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 AC023300.3-201ENST00000623096 5025 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RABGAP1-202ENST00000373647 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEIS2-202ENST00000338564 4829 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 MEIS2-222ENST00000561208 4822 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DGKB-205ENST00000406247 3257 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KLHL13-203ENST00000371878 3234 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 KIAA0355-201ENST00000299505 6717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF490-201ENST00000311437 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 TTLL5-221ENST00000557636 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PDXDC1-210ENST00000563679 2963 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LMOD3-201ENST00000420581 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 RNF40-204ENST00000563683 4063 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 LINC01790-201ENST00000447194 2852 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 R3HDM2-202ENST00000358907 3974 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 COL3A1-202ENST00000317840 3873 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 WISP1-202ENST00000250160 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZMYND8-203ENST00000352431 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 PADI1-201ENST00000375471 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 SPTB-208ENST00000556626 10153 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FGA-201ENST00000302053 3678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 APLNR-202ENST00000606794 3609 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 FAM238C-203ENST00000640121 3620 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
KRTAP9-4Q9BYQ2 HHAT-201ENST00000261458 3594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms