Protein–RNA interactions for Protein: P13378

HOXD8, Homeobox protein Hox-D8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 290 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8P13378 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ADAMTS9-AS2-201ENST00000460833 3691 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SLC12A1-201ENST00000330289 1764 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AJ009632.2-208ENST00000635525 4123 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MROH2B-203ENST00000506092 3745 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 GPN1-205ENST00000458167 1618 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 FNIP1-202ENST00000307968 6388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC011155.1-201ENST00000316512 456 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MIR550A3-201ENST00000390735 95 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PRRC2CP1-201ENST00000404428 159 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01507-201ENST00000417801 446 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL37P1-201ENST00000432310 284 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL049734.2-201ENST00000441066 616 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPS11P7-201ENST00000442125 465 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL7AP10-201ENST00000481016 791 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RN7SL97P-201ENST00000486780 299 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC083923.2-203ENST00000520512 372 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP000676.2-201ENST00000529711 301 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC027130.1-201ENST00000564490 686 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP002799.1-201ENST00000623552 423 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC097495.1-201ENST00000637675 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CLVS1-203ENST00000518592 2880 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ALB-214ENST00000509063 1911 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC109811.1-201ENST00000512833 2807 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CUL4B-204ENST00000404115 3264 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ZNF790-201ENST00000356725 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 GVINP1-201ENST00000526769 8438 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC011933.2-201ENST00000578539 2790 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL078621.3-201ENST00000623707 2042 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-28P-201ENST00000362378 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AL590399.4-201ENST00000436561 601 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LINC01359-203ENST00000444349 381 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPS18P6-201ENST00000476880 458 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 PTPN20-213ENST00000502705 854 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC017037.1-201ENST00000508460 471 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC098829.1-202ENST00000513384 537 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LNX1-AS1-204ENST00000514364 495 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RNU6-988P-201ENST00000519081 107 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 TRAPPC2-208ENST00000519885 561 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 RPL7P20-201ENST00000520308 745 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC068880.2-201ENST00000521016 362 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC024681.2-201ENST00000523525 204 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC024940.3-201ENST00000538551 316 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP001011.1-202ENST00000581172 667 ntTSL 3 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AP000769.2-201ENST00000602344 396 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC090510.2-201ENST00000617465 629 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC099494.2-201ENST00000623371 978 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 CHD2-202ENST00000420239 2221 ntTSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 IRAK1BP1-204ENST00000607739 1387 ntTSL 2 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 SLC1A3-215ENST00000612708 3832 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
HOXD8P13378 ERAP2-202ENST00000437043 5705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6□□□□□ -1.45
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