Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 UGT2A1-206ENST00000514019 2376 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF519P1-201ENST00000449011 1626 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF233-205ENST00000592581 2938 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01505-205ENST00000636028 2298 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC243772.3-201ENST00000617878 1537 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP000808.1-201ENST00000512200 3252 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TCF7L2-210ENST00000369397 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ELAVL2-204ENST00000397312 3805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 THEMIS-204ENST00000537166 3830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RBMY1F-201ENST00000303766 1887 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC026523.2-201ENST00000625039 7739 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CDK14-206ENST00000436577 4787 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 DNAH3-201ENST00000261383 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01689-201ENST00000416218 2007 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 OR6C4-202ENST00000641569 5141 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINS1-201ENST00000314742 4821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZFP62-207ENST00000512132 4010 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 GNG3-201ENST00000294117 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP47-201ENST00000365347 328 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 UBBP2-201ENST00000376781 231 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TRBV7-5-201ENST00000390382 345 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TRAV18-201ENST00000390446 440 ntAPPRIS P1 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PHBP1-201ENST00000392260 808 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SKP148-201ENST00000410179 275 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL451048.1-201ENST00000413328 217 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL7AP73-201ENST00000413490 353 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL354890.1-201ENST00000413730 346 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SCG5-202ENST00000413748 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL591719.2-201ENST00000437400 386 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNU6-953P-201ENST00000459154 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNA5SP103-201ENST00000459503 118 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 OARD1-209ENST00000471367 401 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SL643P-201ENST00000471845 291 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RN7SL382P-201ENST00000482631 282 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC091849.1-201ENST00000509920 121 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC002401.2-201ENST00000511361 430 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 IGHVIII-25-1-201ENST00000522143 241 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP002444.1-201ENST00000534252 620 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP003108.2-208ENST00000543044 883 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 APAF1-207ENST00000547743 651 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC074032.1-202ENST00000552815 467 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AP3S2-214ENST00000560940 519 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 HP-207ENST00000562526 685 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC076968.1-201ENST00000566418 429 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF790-AS1-201ENST00000587278 653 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC007619.2-201ENST00000605743 379 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CUX2P1-201ENST00000606426 298 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 VDAC1P8-210ENST00000610068 1251 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 Metazoa_SRP.192-201ENST00000616260 286 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AC068234.2-201ENST00000619646 522 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PDAP1-205ENST00000626285 120 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SEPT10-205ENST00000415095 1605 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01416-201ENST00000563553 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ADGRF1-203ENST00000371253 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SLC26A7-208ENST00000523719 2902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ABCA10-201ENST00000269081 6362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 GPATCH2L-201ENST00000261530 14007 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SSH2-204ENST00000540801 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 C1orf140-202ENST00000439004 4340 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ZNF189-201ENST00000259395 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL049641.1-201ENST00000441055 1948 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 TRPM3-209ENST00000377110 12258 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 NAPG-201ENST00000322897 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SREK1IP1-204ENST00000513458 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 ATP13A4-202ENST00000342695 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 MLH3-210ENST00000556257 4229 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 OR7D4-203ENST00000641669 4965 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 CDY19P-201ENST00000411668 1613 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 AL138847.1-201ENST00000258651 546 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 PRIM2-201ENST00000274891 864 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 SNORA38B-201ENST00000363524 131 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
ANKRD39Q53RE8 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.4 ms