Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Y1

CAMTA1, Calmodulin-binding transcription activator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA1Q9Y6Y1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CAMTA1Q9Y6Y1 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CAMTA1Q9Y6Y1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms