Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6D5

ARFGEF2, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGEF2Q9Y6D5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARFGEF2Q9Y6D5 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARFGEF2Q9Y6D5 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms