Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W3

KLF2, Krueppel-like factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 355 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF2Q9Y5W3 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
KLF2Q9Y5W3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
KLF2Q9Y5W3 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms