Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y266

NUDC, Nuclear migration protein nudC, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCQ9Y266 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
NUDCQ9Y266 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NUDCQ9Y266 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms