Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQF0

ERVW-1, Syncytin-1, humanhuman

Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVW-1Q9UQF0 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ERVW-1Q9UQF0 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms