Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
HDAC9Q9UKV0 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms