Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI2

CDC42EP3, Cdc42 effector protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP3Q9UKI2 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CDC42EP3Q9UKI2 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms