Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
MRTO4Q9UKD2 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
MRTO4Q9UKD2 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms